Deus Ex 3 jest kolejną częścią słynnego action-RPGa osadzonego w cyberpunkowej wizji przyszłości. Trójka jest prequelem poprzednich części, a za jej powstanie nie odpowiada już ekipa Ion Storm, lecz montrealskie studio firmy Eidos. Pomimo tego fabuła gry przygotowana została we współpracy z autorem scenariusza wcześniejszych odsłon - Sheldonem Pacottim, produkcja otrzymała też wsparcie ze strony Harvey'a Smitha i Warrena Spectora.
Akcja Deus Ex 3 rozgrywa się w 2027 roku w Szanghaju. Futurystyczne miasto podzielone zostało na dwie warstwy reprezentujące status społeczny ich mieszkańców - dla bogaczy zarezerwowana jest górna strefa, natomiast biedota żyje w dolnej warstwie, pozostającej w wiecznym półmroku. Niebo nad tym niezbyt przyjaznym miejscem wciąż przecinają transportowce wyposażone w migające, holograficzne ekrany. Wcielamy się tu w rolę Adama Jensena, przeciętnego faceta pełniącego funkcję ochroniarza w laboratorium prowadzącym badania nad biomechanicznymi ulepszeniami. W przyszłości to właśnie one doprowadzą do powstania znanych z poprzednich odsłon mikrowszczepów. Pewnego dnia życie bohatera całkowicie się zmienia - do głównej siedziby laboratorium wdziera się oddział sił specjalnych i urządza prawdziwą rzeź. W dodatku atak ten umożliwiły plany budynku sporządzone własnoręcznie przez Jensena.
Twórcy gry postarali się wyeliminować większość aspektów Deus Ex: Invisible War, na które narzekali fani oryginału - takich na przykład jak jeden rodzaj amunicji wykorzystywany przez wszystkie bronie. Walka z przeciwnikami przypomina typowego FPS-a, zwłaszcza że skuteczność naszego bohatera zależy przede wszystkim od naszych umiejętności, a nie statystyk. Duży wpływ na przebieg starć mają też usprawnienia broni - możemy zamontować w nich różnego rodzaju magazynki, lunetki, celowniki czy tłumiki. Osoby wolące atakować z zaskoczenia muszą zmienić swoje dotychczasowe przyzwyczajania, gdyż tutaj od ukrywania się w cieniu ważniejsze jest szukanie osłony za różnymi elementami otoczenia. System doznawania ran i ich regeneracji przypomina ten znany z nowszych części serii Call of Duty, czyli po pewnym (krótkim) czasie postać wraca do pełni sił. Twórcy przygotowali dla nas dwadzieścia wszczepów, a wśród nich znalazły się m.in. takie, które umożliwiają schodzenie z wysokich budynków na wyrastających z pleców mackach, czy przebijanie się pięścią przez ściany (aby dopaść wrogów czyhających w sąsiednim pomieszczeniu).
Deus Ex 3 charakteryzuje się świetnie zrealizowaną oprawą graficzną. Jeżeli zaś chodzi o klimat produkcji to stanowi on połączenie cyberpunku z elementami projektów Leonarda da Vinci.